Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2CQ14957 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2CQ14957 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2CQ14957 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN2CQ14957 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIN2CQ14957 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIN2CQ14957 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2CQ14957 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms