Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2H3Q13889 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2H3Q13889 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2H3Q13889 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H3Q13889 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H3Q13889 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms