Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTAN1Q13813 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTAN1Q13813 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTAN1Q13813 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTAN1Q13813 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTAN1Q13813 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTAN1Q13813 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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