Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRQ13535 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRQ13535 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRQ13535 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRQ13535 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRQ13535 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRQ13535 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRQ13535 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRQ13535 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRQ13535 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRQ13535 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRQ13535 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRQ13535 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRQ13535 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRQ13535 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRQ13535 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRQ13535 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRQ13535 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRQ13535 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRQ13535 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRQ13535 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRQ13535 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRQ13535 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRQ13535 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRQ13535 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRQ13535 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRQ13535 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRQ13535 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRQ13535 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRQ13535 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRQ13535 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRQ13535 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRQ13535 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRQ13535 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRQ13535 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRQ13535 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRQ13535 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRQ13535 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRQ13535 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRQ13535 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRQ13535 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRQ13535 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRQ13535 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRQ13535 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRQ13535 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRQ13535 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRQ13535 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRQ13535 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRQ13535 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRQ13535 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRQ13535 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRQ13535 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRQ13535 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRQ13535 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRQ13535 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRQ13535 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRQ13535 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRQ13535 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRQ13535 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRQ13535 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRQ13535 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRQ13535 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRQ13535 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRQ13535 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRQ13535 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATRQ13535 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATRQ13535 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRQ13535 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRQ13535 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRQ13535 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRQ13535 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRQ13535 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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