Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms