Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN3Q13033 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN3Q13033 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN3Q13033 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN3Q13033 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STRN3Q13033 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1685.3 ms