Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PMPCAQ10713 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCAQ10713 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMPCAQ10713 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCAQ10713 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCAQ10713 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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