Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGM3Q08188 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGM3Q08188 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TGM3Q08188 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGM3Q08188 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGM3Q08188 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms