Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKCQQ04759 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCQQ04759 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCQQ04759 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCQQ04759 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKCQQ04759 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCQQ04759 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms