Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELBQ01201 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELBQ01201 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELBQ01201 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RELBQ01201 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELBQ01201 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELBQ01201 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELBQ01201 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELBQ01201 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELBQ01201 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELBQ01201 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELBQ01201 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELBQ01201 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELBQ01201 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELBQ01201 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELBQ01201 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RELBQ01201 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RELBQ01201 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELBQ01201 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELBQ01201 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RELBQ01201 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RELBQ01201 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELBQ01201 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RELBQ01201 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RELBQ01201 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RELBQ01201 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELBQ01201 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RELBQ01201 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELBQ01201 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RELBQ01201 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RELBQ01201 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELBQ01201 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELBQ01201 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RELBQ01201 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RELBQ01201 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RELBQ01201 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RELBQ01201 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RELBQ01201 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELBQ01201 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELBQ01201 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RELBQ01201 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RELBQ01201 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELBQ01201 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELBQ01201 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELBQ01201 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELBQ01201 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELBQ01201 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELBQ01201 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELBQ01201 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELBQ01201 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELBQ01201 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELBQ01201 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELBQ01201 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RELBQ01201 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELBQ01201 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELBQ01201 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELBQ01201 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELBQ01201 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RELBQ01201 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELBQ01201 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELBQ01201 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELBQ01201 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELBQ01201 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELBQ01201 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELBQ01201 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELBQ01201 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELBQ01201 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELBQ01201 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELBQ01201 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RELBQ01201 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RELBQ01201 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELBQ01201 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELBQ01201 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELBQ01201 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELBQ01201 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELBQ01201 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELBQ01201 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RELBQ01201 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELBQ01201 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELBQ01201 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELBQ01201 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELBQ01201 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RELBQ01201 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RELBQ01201 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RELBQ01201 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RELBQ01201 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RELBQ01201 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RELBQ01201 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELBQ01201 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELBQ01201 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELBQ01201 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELBQ01201 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms