Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK2A1P68400 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK2A1P68400 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms