Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCALDP61601 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCALDP61601 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCALDP61601 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCALDP61601 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCALDP61601 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCALDP61601 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCALDP61601 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCALDP61601 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCALDP61601 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCALDP61601 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCALDP61601 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCALDP61601 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCALDP61601 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCALDP61601 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCALDP61601 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCALDP61601 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCALDP61601 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCALDP61601 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCALDP61601 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCALDP61601 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCALDP61601 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCALDP61601 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCALDP61601 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCALDP61601 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCALDP61601 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCALDP61601 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCALDP61601 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCALDP61601 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCALDP61601 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCALDP61601 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCALDP61601 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCALDP61601 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCALDP61601 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCALDP61601 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCALDP61601 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCALDP61601 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCALDP61601 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCALDP61601 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCALDP61601 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCALDP61601 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCALDP61601 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCALDP61601 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCALDP61601 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCALDP61601 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCALDP61601 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCALDP61601 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCALDP61601 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCALDP61601 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCALDP61601 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCALDP61601 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCALDP61601 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCALDP61601 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCALDP61601 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCALDP61601 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCALDP61601 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCALDP61601 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCALDP61601 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCALDP61601 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCALDP61601 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCALDP61601 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCALDP61601 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCALDP61601 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCALDP61601 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCALDP61601 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCALDP61601 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCALDP61601 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCALDP61601 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCALDP61601 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCALDP61601 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCALDP61601 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCALDP61601 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCALDP61601 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCALDP61601 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCALDP61601 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCALDP61601 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCALDP61601 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCALDP61601 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCALDP61601 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCALDP61601 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCALDP61601 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCALDP61601 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCALDP61601 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCALDP61601 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCALDP61601 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCALDP61601 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCALDP61601 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCALDP61601 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCALDP61601 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCALDP61601 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCALDP61601 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCALDP61601 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCALDP61601 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCALDP61601 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCALDP61601 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCALDP61601 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCALDP61601 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCALDP61601 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCALDP61601 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCALDP61601 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms