Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB8AP61006 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB8AP61006 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB8AP61006 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB8AP61006 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB8AP61006 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB8AP61006 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB8AP61006 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB8AP61006 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB8AP61006 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB8AP61006 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms