Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4BP1P59074 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHMP4BP1P59074 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP4BP1P59074 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP4BP1P59074 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP4BP1P59074 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms