Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PEX3P56589 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PEX3P56589 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PEX3P56589 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PEX3P56589 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PEX3P56589 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PEX3P56589 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PEX3P56589 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PEX3P56589 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PEX3P56589 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PEX3P56589 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PEX3P56589 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PEX3P56589 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PEX3P56589 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PEX3P56589 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PEX3P56589 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PEX3P56589 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PEX3P56589 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PEX3P56589 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PEX3P56589 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PEX3P56589 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PEX3P56589 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PEX3P56589 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PEX3P56589 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PEX3P56589 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PEX3P56589 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PEX3P56589 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PEX3P56589 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PEX3P56589 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PEX3P56589 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PEX3P56589 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PEX3P56589 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PEX3P56589 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PEX3P56589 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PEX3P56589 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PEX3P56589 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PEX3P56589 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PEX3P56589 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PEX3P56589 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PEX3P56589 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PEX3P56589 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PEX3P56589 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PEX3P56589 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PEX3P56589 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PEX3P56589 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PEX3P56589 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PEX3P56589 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PEX3P56589 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PEX3P56589 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PEX3P56589 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PEX3P56589 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PEX3P56589 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PEX3P56589 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX3P56589 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX3P56589 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX3P56589 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX3P56589 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX3P56589 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX3P56589 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PEX3P56589 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PEX3P56589 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PEX3P56589 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PEX3P56589 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PEX3P56589 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PEX3P56589 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PEX3P56589 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PEX3P56589 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PEX3P56589 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PEX3P56589 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PEX3P56589 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PEX3P56589 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PEX3P56589 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PEX3P56589 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PEX3P56589 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PEX3P56589 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PEX3P56589 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PEX3P56589 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PEX3P56589 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PEX3P56589 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PEX3P56589 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PEX3P56589 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PEX3P56589 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PEX3P56589 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PEX3P56589 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PEX3P56589 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PEX3P56589 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PEX3P56589 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PEX3P56589 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PEX3P56589 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PEX3P56589 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PEX3P56589 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PEX3P56589 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PEX3P56589 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PEX3P56589 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PEX3P56589 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PEX3P56589 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PEX3P56589 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PEX3P56589 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PEX3P56589 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PEX3P56589 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms