Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXG1P55316 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXG1P55316 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXG1P55316 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXG1P55316 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms