Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHB1P54762 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPHB1P54762 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EPHB1P54762 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB1P54762 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHB1P54762 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHB1P54762 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms