Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATN1P54259 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATN1P54259 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATN1P54259 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATN1P54259 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATN1P54259 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATN1P54259 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATN1P54259 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATN1P54259 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATN1P54259 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATN1P54259 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATN1P54259 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATN1P54259 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATN1P54259 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATN1P54259 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATN1P54259 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATN1P54259 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATN1P54259 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATN1P54259 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATN1P54259 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATN1P54259 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATN1P54259 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATN1P54259 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATN1P54259 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATN1P54259 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATN1P54259 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATN1P54259 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATN1P54259 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATN1P54259 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATN1P54259 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATN1P54259 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATN1P54259 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATN1P54259 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATN1P54259 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATN1P54259 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATN1P54259 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATN1P54259 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATN1P54259 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATN1P54259 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATN1P54259 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATN1P54259 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATN1P54259 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATN1P54259 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATN1P54259 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATN1P54259 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATN1P54259 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATN1P54259 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATN1P54259 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATN1P54259 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATN1P54259 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATN1P54259 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATN1P54259 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATN1P54259 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATN1P54259 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATN1P54259 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATN1P54259 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATN1P54259 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATN1P54259 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATN1P54259 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATN1P54259 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ATN1P54259 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATN1P54259 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATN1P54259 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATN1P54259 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATN1P54259 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATN1P54259 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATN1P54259 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATN1P54259 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATN1P54259 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATN1P54259 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATN1P54259 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATN1P54259 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATN1P54259 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATN1P54259 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATN1P54259 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATN1P54259 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATN1P54259 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATN1P54259 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATN1P54259 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATN1P54259 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATN1P54259 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATN1P54259 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATN1P54259 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATN1P54259 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATN1P54259 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATN1P54259 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATN1P54259 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATN1P54259 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATN1P54259 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATN1P54259 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATN1P54259 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATN1P54259 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATN1P54259 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATN1P54259 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATN1P54259 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATN1P54259 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATN1P54259 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATN1P54259 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATN1P54259 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATN1P54259 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms