Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KNTC1P50748 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNTC1P50748 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNTC1P50748 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNTC1P50748 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms