Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLCSP50747 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLCSP50747 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLCSP50747 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLCSP50747 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLCSP50747 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLCSP50747 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLCSP50747 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLCSP50747 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLCSP50747 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLCSP50747 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLCSP50747 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLCSP50747 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLCSP50747 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLCSP50747 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLCSP50747 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLCSP50747 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLCSP50747 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HLCSP50747 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLCSP50747 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLCSP50747 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLCSP50747 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLCSP50747 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLCSP50747 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLCSP50747 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLCSP50747 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLCSP50747 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLCSP50747 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLCSP50747 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLCSP50747 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLCSP50747 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLCSP50747 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLCSP50747 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLCSP50747 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLCSP50747 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLCSP50747 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HLCSP50747 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLCSP50747 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLCSP50747 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HLCSP50747 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLCSP50747 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLCSP50747 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLCSP50747 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLCSP50747 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLCSP50747 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLCSP50747 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLCSP50747 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLCSP50747 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLCSP50747 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLCSP50747 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLCSP50747 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLCSP50747 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLCSP50747 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLCSP50747 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLCSP50747 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLCSP50747 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLCSP50747 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLCSP50747 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLCSP50747 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLCSP50747 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLCSP50747 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HLCSP50747 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLCSP50747 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLCSP50747 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLCSP50747 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLCSP50747 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HLCSP50747 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HLCSP50747 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLCSP50747 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLCSP50747 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLCSP50747 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLCSP50747 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLCSP50747 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLCSP50747 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLCSP50747 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLCSP50747 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLCSP50747 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLCSP50747 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLCSP50747 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLCSP50747 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLCSP50747 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLCSP50747 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLCSP50747 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLCSP50747 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms