Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF4P23510 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF4P23510 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF4P23510 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF4P23510 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF4P23510 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms