Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
S1PR1P21453 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
S1PR1P21453 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
S1PR1P21453 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
S1PR1P21453 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
S1PR1P21453 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
S1PR1P21453 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
S1PR1P21453 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1626.4 ms