Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NF1P21359 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NF1P21359 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NF1P21359 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NF1P21359 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NF1P21359 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NF1P21359 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NF1P21359 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NF1P21359 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NF1P21359 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NF1P21359 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NF1P21359 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NF1P21359 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NF1P21359 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NF1P21359 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NF1P21359 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NF1P21359 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NF1P21359 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NF1P21359 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NF1P21359 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NF1P21359 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NF1P21359 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NF1P21359 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NF1P21359 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NF1P21359 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NF1P21359 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NF1P21359 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NF1P21359 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NF1P21359 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NF1P21359 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NF1P21359 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NF1P21359 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NF1P21359 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NF1P21359 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NF1P21359 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NF1P21359 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NF1P21359 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NF1P21359 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NF1P21359 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NF1P21359 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NF1P21359 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NF1P21359 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NF1P21359 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NF1P21359 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NF1P21359 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NF1P21359 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NF1P21359 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NF1P21359 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NF1P21359 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NF1P21359 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NF1P21359 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NF1P21359 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NF1P21359 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NF1P21359 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NF1P21359 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NF1P21359 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NF1P21359 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NF1P21359 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NF1P21359 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NF1P21359 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NF1P21359 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NF1P21359 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NF1P21359 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NF1P21359 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NF1P21359 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NF1P21359 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NF1P21359 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NF1P21359 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NF1P21359 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NF1P21359 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NF1P21359 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NF1P21359 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NF1P21359 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NF1P21359 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NF1P21359 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NF1P21359 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NF1P21359 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NF1P21359 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NF1P21359 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NF1P21359 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NF1P21359 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NF1P21359 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NF1P21359 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NF1P21359 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NF1P21359 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NF1P21359 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NF1P21359 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NF1P21359 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NF1P21359 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NF1P21359 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NF1P21359 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NF1P21359 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NF1P21359 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NF1P21359 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NF1P21359 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NF1P21359 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NF1P21359 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NF1P21359 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NF1P21359 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NF1P21359 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms