Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAM1P13591 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAM1P13591 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCAM1P13591 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAM1P13591 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAM1P13591 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms