Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT18P05783 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT18P05783 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT18P05783 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT18P05783 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT18P05783 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT18P05783 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT18P05783 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT18P05783 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT18P05783 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT18P05783 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT18P05783 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT18P05783 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT18P05783 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT18P05783 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT18P05783 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT18P05783 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT18P05783 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT18P05783 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT18P05783 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT18P05783 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT18P05783 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT18P05783 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT18P05783 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT18P05783 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT18P05783 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT18P05783 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT18P05783 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT18P05783 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT18P05783 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT18P05783 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT18P05783 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT18P05783 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT18P05783 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT18P05783 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT18P05783 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT18P05783 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT18P05783 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT18P05783 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT18P05783 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT18P05783 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT18P05783 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT18P05783 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT18P05783 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT18P05783 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT18P05783 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT18P05783 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT18P05783 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT18P05783 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT18P05783 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT18P05783 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT18P05783 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT18P05783 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT18P05783 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT18P05783 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT18P05783 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT18P05783 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT18P05783 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT18P05783 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT18P05783 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT18P05783 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT18P05783 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT18P05783 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT18P05783 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT18P05783 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT18P05783 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT18P05783 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT18P05783 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT18P05783 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT18P05783 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT18P05783 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT18P05783 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT18P05783 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT18P05783 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT18P05783 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT18P05783 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT18P05783 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT18P05783 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT18P05783 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT18P05783 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT18P05783 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT18P05783 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT18P05783 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT18P05783 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT18P05783 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT18P05783 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT18P05783 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT18P05783 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT18P05783 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT18P05783 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT18P05783 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT18P05783 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT18P05783 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT18P05783 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT18P05783 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT18P05783 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT18P05783 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT18P05783 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT18P05783 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT18P05783 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.7 ms