Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNC2P02585 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNC2P02585 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNC2P02585 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNC2P02585 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNNC2P02585 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms