Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA2P01563 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA2P01563 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA2P01563 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA2P01563 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms