Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PCNTO95613 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PCNTO95613 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PCNTO95613 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PCNTO95613 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PCNTO95613 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PCNTO95613 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PCNTO95613 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PCNTO95613 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PCNTO95613 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PCNTO95613 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PCNTO95613 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PCNTO95613 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PCNTO95613 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PCNTO95613 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCNTO95613 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PCNTO95613 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCNTO95613 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCNTO95613 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PCNTO95613 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PCNTO95613 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PCNTO95613 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PCNTO95613 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PCNTO95613 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PCNTO95613 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PCNTO95613 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCNTO95613 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCNTO95613 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCNTO95613 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PCNTO95613 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PCNTO95613 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PCNTO95613 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCNTO95613 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCNTO95613 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCNTO95613 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCNTO95613 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCNTO95613 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCNTO95613 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCNTO95613 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCNTO95613 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCNTO95613 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCNTO95613 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCNTO95613 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCNTO95613 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PCNTO95613 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PCNTO95613 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PCNTO95613 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PCNTO95613 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PCNTO95613 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCNTO95613 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCNTO95613 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCNTO95613 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCNTO95613 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PCNTO95613 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PCNTO95613 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PCNTO95613 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PCNTO95613 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PCNTO95613 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PCNTO95613 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PCNTO95613 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PCNTO95613 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PCNTO95613 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PCNTO95613 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PCNTO95613 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PCNTO95613 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCNTO95613 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCNTO95613 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCNTO95613 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCNTO95613 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PCNTO95613 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCNTO95613 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCNTO95613 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCNTO95613 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCNTO95613 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCNTO95613 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCNTO95613 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCNTO95613 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCNTO95613 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PCNTO95613 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCNTO95613 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCNTO95613 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCNTO95613 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCNTO95613 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms