Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PCNTO95613 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PCNTO95613 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PCNTO95613 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PCNTO95613 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PCNTO95613 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PCNTO95613 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PCNTO95613 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PCNTO95613 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PCNTO95613 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PCNTO95613 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PCNTO95613 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PCNTO95613 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PCNTO95613 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PCNTO95613 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCNTO95613 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PCNTO95613 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCNTO95613 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCNTO95613 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PCNTO95613 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PCNTO95613 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PCNTO95613 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PCNTO95613 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PCNTO95613 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PCNTO95613 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PCNTO95613 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCNTO95613 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCNTO95613 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCNTO95613 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCNTO95613 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCNTO95613 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PCNTO95613 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PCNTO95613 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PCNTO95613 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCNTO95613 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCNTO95613 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCNTO95613 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCNTO95613 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCNTO95613 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCNTO95613 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCNTO95613 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCNTO95613 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCNTO95613 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCNTO95613 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCNTO95613 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCNTO95613 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PCNTO95613 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PCNTO95613 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PCNTO95613 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PCNTO95613 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PCNTO95613 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCNTO95613 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCNTO95613 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCNTO95613 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCNTO95613 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PCNTO95613 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PCNTO95613 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PCNTO95613 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PCNTO95613 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PCNTO95613 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PCNTO95613 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PCNTO95613 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PCNTO95613 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PCNTO95613 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PCNTO95613 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PCNTO95613 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PCNTO95613 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCNTO95613 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCNTO95613 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCNTO95613 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PCNTO95613 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PCNTO95613 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PCNTO95613 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCNTO95613 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCNTO95613 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCNTO95613 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PCNTO95613 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCNTO95613 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCNTO95613 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCNTO95613 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PCNTO95613 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PCNTO95613 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCNTO95613 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCNTO95613 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCNTO95613 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCNTO95613 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms