Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAMP5O95183 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAMP5O95183 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP5O95183 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP5O95183 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms