Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTN5O94779 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTN5O94779 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN5O94779 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN5O94779 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN5O94779 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms