Protein–RNA interactions for Protein: O75628

REM1, GTP-binding protein REM 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REM1O75628 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REM1O75628 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REM1O75628 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REM1O75628 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REM1O75628 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REM1O75628 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REM1O75628 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REM1O75628 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REM1O75628 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REM1O75628 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
REM1O75628 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REM1O75628 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REM1O75628 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REM1O75628 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REM1O75628 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REM1O75628 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REM1O75628 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REM1O75628 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REM1O75628 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REM1O75628 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REM1O75628 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REM1O75628 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REM1O75628 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
REM1O75628 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REM1O75628 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REM1O75628 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REM1O75628 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REM1O75628 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REM1O75628 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REM1O75628 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REM1O75628 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REM1O75628 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REM1O75628 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
REM1O75628 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
REM1O75628 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
REM1O75628 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
REM1O75628 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REM1O75628 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REM1O75628 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
REM1O75628 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
REM1O75628 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
REM1O75628 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
REM1O75628 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REM1O75628 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
REM1O75628 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REM1O75628 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REM1O75628 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
REM1O75628 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REM1O75628 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REM1O75628 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REM1O75628 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REM1O75628 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REM1O75628 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REM1O75628 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REM1O75628 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REM1O75628 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REM1O75628 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REM1O75628 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
REM1O75628 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
REM1O75628 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
REM1O75628 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REM1O75628 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
REM1O75628 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REM1O75628 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REM1O75628 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REM1O75628 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REM1O75628 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REM1O75628 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REM1O75628 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REM1O75628 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REM1O75628 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REM1O75628 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REM1O75628 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REM1O75628 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REM1O75628 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REM1O75628 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REM1O75628 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REM1O75628 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REM1O75628 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REM1O75628 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REM1O75628 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REM1O75628 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REM1O75628 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REM1O75628 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REM1O75628 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REM1O75628 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REM1O75628 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REM1O75628 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REM1O75628 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REM1O75628 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REM1O75628 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
REM1O75628 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
REM1O75628 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
REM1O75628 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
REM1O75628 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
REM1O75628 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
REM1O75628 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
REM1O75628 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
REM1O75628 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
REM1O75628 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms