Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM3O75382 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM3O75382 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM3O75382 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM3O75382 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms