Protein–RNA interactions for Protein: O60739

EIF1B, Eukaryotic translation initiation factor 1b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF1BO60739 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF1BO60739 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF1BO60739 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF1BO60739 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF1BO60739 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF1BO60739 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF1BO60739 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF1BO60739 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF1BO60739 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF1BO60739 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms