Protein–RNA interactions for Protein: O60243

HS6ST1, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST1O60243 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS6ST1O60243 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS6ST1O60243 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS6ST1O60243 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS6ST1O60243 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS6ST1O60243 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS6ST1O60243 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS6ST1O60243 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HS6ST1O60243 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS6ST1O60243 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HS6ST1O60243 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HS6ST1O60243 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS6ST1O60243 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms