Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1GO43497 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1GO43497 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1GO43497 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1GO43497 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1GO43497 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1GO43497 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1GO43497 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms