Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPF3O43395 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPF3O43395 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPF3O43395 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF3O43395 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF3O43395 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms