Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTBN2O15020 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN2O15020 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN2O15020 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBN2O15020 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN2O15020 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SPTBN2O15020 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTBN2O15020 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms