Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDKO14874 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDKO14874 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCKDKO14874 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
BCKDKO14874 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BCKDKO14874 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms