Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP1O00294 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP1O00294 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP1O00294 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP1O00294 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP1O00294 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP1O00294 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP1O00294 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP1O00294 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TULP1O00294 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TULP1O00294 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TULP1O00294 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP1O00294 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP1O00294 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP1O00294 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP1O00294 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP1O00294 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP1O00294 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP1O00294 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP1O00294 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP1O00294 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP1O00294 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP1O00294 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP1O00294 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP1O00294 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP1O00294 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP1O00294 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP1O00294 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP1O00294 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP1O00294 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP1O00294 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP1O00294 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP1O00294 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP1O00294 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP1O00294 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP1O00294 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP1O00294 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP1O00294 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP1O00294 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP1O00294 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP1O00294 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TULP1O00294 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TULP1O00294 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP1O00294 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP1O00294 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP1O00294 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP1O00294 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP1O00294 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP1O00294 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP1O00294 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP1O00294 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP1O00294 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TULP1O00294 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP1O00294 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP1O00294 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP1O00294 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP1O00294 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP1O00294 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP1O00294 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP1O00294 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TULP1O00294 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP1O00294 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP1O00294 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP1O00294 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP1O00294 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP1O00294 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP1O00294 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP1O00294 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP1O00294 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP1O00294 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP1O00294 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP1O00294 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP1O00294 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP1O00294 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP1O00294 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP1O00294 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP1O00294 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP1O00294 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP1O00294 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP1O00294 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP1O00294 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP1O00294 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP1O00294 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP1O00294 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP1O00294 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP1O00294 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP1O00294 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP1O00294 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP1O00294 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP1O00294 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP1O00294 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP1O00294 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP1O00294 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP1O00294 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP1O00294 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP1O00294 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP1O00294 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP1O00294 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP1O00294 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP1O00294 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms