Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms