Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H7C0S8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H7C0S8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
H7C0S8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H7C0S8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H7C0S8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C0S8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C0S8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C0S8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H7C0S8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H7C0S8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C0S8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C0S8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C0S8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H7C0S8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C0S8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H7C0S8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C0S8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C0S8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H7C0S8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C0S8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H7C0S8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C0S8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H7C0S8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C0S8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H7C0S8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
H7C0S8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C0S8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C0S8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C0S8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C0S8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H7C0S8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C0S8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C0S8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C0S8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C0S8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H7C0S8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C0S8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C0S8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C0S8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C0S8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C0S8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C0S8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C0S8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C0S8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C0S8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C0S8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C0S8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C0S8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C0S8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C0S8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C0S8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C0S8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C0S8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C0S8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C0S8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C0S8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C0S8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C0S8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C0S8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C0S8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C0S8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C0S8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C0S8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C0S8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C0S8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C0S8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C0S8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H7C0S8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C0S8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C0S8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C0S8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0S8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0S8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0S8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0S8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0S8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C0S8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C0S8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C0S8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H7C0S8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C0S8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C0S8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C0S8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H7C0S8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C0S8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C0S8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0S8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0S8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0S8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0S8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0S8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0S8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0S8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0S8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0S8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0S8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0S8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0S8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0S8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms