Protein–RNA interactions for Protein: C9JVW0

INAFM1, Putative transmembrane protein INAFM1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INAFM1C9JVW0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INAFM1C9JVW0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
INAFM1C9JVW0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.32■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.3■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
INAFM1C9JVW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
INAFM1C9JVW0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
INAFM1C9JVW0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms