Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PALM2-AKAP2B1ALY0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM2-AKAP2B1ALY0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALM2-AKAP2B1ALY0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms