Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SETBP1Q9Y6X0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SETBP1Q9Y6X0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SETBP1Q9Y6X0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SETBP1Q9Y6X0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SETBP1Q9Y6X0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SETBP1Q9Y6X0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SETBP1Q9Y6X0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SETBP1Q9Y6X0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SETBP1Q9Y6X0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETBP1Q9Y6X0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SETBP1Q9Y6X0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SETBP1Q9Y6X0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SETBP1Q9Y6X0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SETBP1Q9Y6X0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SETBP1Q9Y6X0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SETBP1Q9Y6X0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SETBP1Q9Y6X0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SETBP1Q9Y6X0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SETBP1Q9Y6X0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SETBP1Q9Y6X0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SETBP1Q9Y6X0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SETBP1Q9Y6X0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SETBP1Q9Y6X0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SETBP1Q9Y6X0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SETBP1Q9Y6X0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SETBP1Q9Y6X0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETBP1Q9Y6X0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SETBP1Q9Y6X0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms