Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J9

TAF6L, TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6LQ9Y6J9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF6LQ9Y6J9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TAF6LQ9Y6J9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TAF6LQ9Y6J9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TAF6LQ9Y6J9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TAF6LQ9Y6J9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TAF6LQ9Y6J9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TAF6LQ9Y6J9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TAF6LQ9Y6J9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms