Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB13Q9Y5F0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB13Q9Y5F0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB13Q9Y5F0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCDHB13Q9Y5F0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCDHB13Q9Y5F0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB13Q9Y5F0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms