Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMC9Q9Y3B6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC9Q9Y3B6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMC9Q9Y3B6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMC9Q9Y3B6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms