Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNFSF13BQ9Y275 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFSF13BQ9Y275 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNFSF13BQ9Y275 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNFSF13BQ9Y275 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFSF13BQ9Y275 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFSF13BQ9Y275 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFSF13BQ9Y275 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFSF13BQ9Y275 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFSF13BQ9Y275 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms