Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACFD1Q9UGQ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACFD1Q9UGQ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACFD1Q9UGQ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACFD1Q9UGQ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACFD1Q9UGQ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACFD1Q9UGQ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms