Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB11Q9UBS4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJB11Q9UBS4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAJB11Q9UBS4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJB11Q9UBS4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms